Bjørvikatunnelen bygges med seks gjennomgående kjørefelt og med planskilte kryss som gir tilknytning til eksisterende gatenett ved Havnelageret og på Sørenga. I krysset ved Havnelageret knyttes rampe med opp- og nedkjøring fra tunnelen til Rådhusgata. Rampen ligger på bysiden av Havnelageret. Påkjøring til østgående løp i tunnelen skjer fra Skippergata syd for Havnelageret. Sørengkrysset er utformet slik at adkomst fra Ekebergtunnelen og Mosseveien til byen skjer via rundkjøring på Mosseveien og bro ned på Sørenga. Av kapasitetsmessige hensyn har krysset i tillegg sekundære veiforbindelser, hvorav en er lagt i fjell.
